巴楚县位于新疆西南部，天山南麓，塔里木盆地和塔克拉玛干沙漠西北边缘。东与阿瓦提县、墨玉县接壤，北与柯坪县、阿合奇县毗邻，南与麦盖提县、皮山县相连，西与伽师县、岳普湖县、阿图什市相接。县城巴楚镇距乌鲁木齐市1255千米。全县总面积18490.59平方千米，总人口388247人（2003年）。有维吾尔、汉、回、乌孜别克、柯尔克孜、哈萨克等民族。
　　地势从西南向东北倾斜，主要地貌特征为沙漠、山地、洪积平原和冲积平原四大类组成。主要河流为叶尔羌河。属温带大陆性干燥气候，四季分明，夏长冬短，干旱少雨，风沙天较多。

  　　巴楚，是巴尔楚克的简称。《西域图志》作巴尔楚克，《西陲要略》作巴里楚克。据《西域同文志》释：“巴尔楚克，全有也。地饶水草，故名。”维吾尔语称作玛热勒巴什，旧有玛喇巴什、毛拉巴什等不同译名，意为鹿首。
　　汉为西域尉头国地，三国、北魏时属龟兹，隋时属疏勒。唐代为安西都护府下属的尉头州。元代属别失八里行尚书省，明代属东察合台汗国，后属准噶尔。清乾隆二十六年（1761年）设叶尔羌办事大臣，巴楚归叶尔羌管辖，是阿克苏与叶尔羌、喀什噶尔间的军事、交通重镇。清光绪三年冬（1877年）清军刘锦棠率部平定阿古柏之乱，驻扎在巴尔楚克。乾隆年间设军台，称巴尔楚克台，为叶尔羌到阿克苏十六军台之一。道光十二年（1832年）筑玛拉巴什城。清光绪九年（1883年）置玛喇巴什直隶厅，属喀什噶尔道。光绪二十九年（1903年）直隶厅改设为州，称巴楚州，隶莎车府，下辖八大庄。1913年改设巴楚县，属喀什噶尔道，1929年属喀什行政区。1943年属喀什督察专区。1949年后，先后属喀什专区、南疆行政区。1956年复改喀什专区，1978年后属喀什地区。

　　1999年，巴楚县辖4镇、8乡：巴楚镇、阿瓦提镇、色力布亚镇、三岔口镇、英吾斯塘乡、琼库尔恰克乡、阿克萨克马热勒乡、夏马勒乡、多来提巴格乡、阿拉格尔乡、阿纳库勒乡、恰尔巴格乡。年末总人口242166人，其中少数民族228824人，农村人口191325人。

　　2000年，巴楚县辖4个镇、8个乡。全县总人口375883人，其中：巴楚镇 33622人、色力布亚镇 32052人、阿瓦提镇 19003人、三岔口镇 1113人、恰尔巴格乡 21531人、多来提巴格乡 23403人、阿纳库勒乡 17425人、夏马勒乡 8280人、阿克萨克马热勒乡 23561人、阿拉格尔乡 22922人、琼库尔恰克乡 32109人、英吾斯塘乡 19922人、喀拉拜勒9498人、永安坝 946人、夏和林场 131人、克拉克勤劳改农场 2508人、兵团44团 8197人、兵团48团 7293人、兵团49团 11463人、兵团50团 16296人、兵团51团32445人、兵团52团 14219人、兵团53团 17944人。